En el supuesto de una reacción deuterio–tritio (D-T), los productos son átomos de helio-4, que no es radiactivo, y un neutrón, que es el que porta la mayor parte de la energía (14.1 MeV). Sin embargo, al tratarse de una instalación nuclear, hay que considerar que se generará una cola de residuos de baja y media actividad procedente de tareas de descontaminación.
Además, el efecto del campo neutrónico de alta energía sobre los metales que componen la estructura del reactor activarán los componentes dando lugar a residuos potencialmente muy peligrosos.
Con respecto a la energía de fisión nuclear, cabe añadir que los residuos se producirán en mucha menor cantidad y serán mucho más fáciles de gestionar por el tiempo de actividad.